Санитарно-эпидемиологическая служба является одним из важных государственных органов. Главной задачей органа является планирование и ведение учета по статистике и динамике паразитарных и инфекционных заболеваний. Также организация старается проводить эффективные исследования в своей области, чтобы уменьшить количество инфекционных и паразитарных болезней среди населения. Деятельность службы проходит с соблюдением всех правил и нормативов, которые были созданы в государстве. СЭС подчиняется Министерству национальной экономики страны.
На сегодняшний день служба планирует изменить решение некоторых задач, что сделает ее более эффективной. Главными целями организации являются:
Также служба принимает участие в государственной разработке программ, которые помогут обеспечить санитарное и эпидемиологическое благополучие населения Казахстана. Ею утверждаются нормы и санитарные правила, а также важные нормативы гигиены населения. Научно-исследовательские институты службы занимаются изучением эпидемиологической ситуации в Республике.